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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
01/11/2012 |
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Data da última atualização: |
26/05/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CUNHA, I. S.; BARRETO, C. C.; COSTA, O. Y. A.; BOMFIM, M. A. D.; CASTRO, A. P. de; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. |
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Afiliação: |
ISABEL de SOUZA da CUNHA, Universidade Católica de Brasília (UCB) - Brasília, DF.; CRISTINE CHAVES BARRETO, UCB - Brasília, DF.; OHANA Y. A. COSTA, UCB - Brasília, DF.; MARCO AURELIO DELMONDES BOMFIM, CNPC; Alinne Pereira de Castro, University of Brasilia (UNB) - Brasilia, DF.; Ricardo Henrique Kruger, UNB - Brasília, DF.; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE. |
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Título: |
Bacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Anaerobe, London, v. 17, n. 3, p. 118-124, Jul. 2011. |
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DOI: |
doi:10.1016/j.anaerobe.2011.04.018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Most studies present in the literature about the rumen microbiome have focused on cattle and sheep. This is the first report of the characterization of the bacterial and archaeal communities present in the liquid and solid-associated fractions of the rumen from free ranging Moxotó breed goats using 16S rRNA gene libraries. PCR was used to amplify the 16S rRNA gene with bacterial and archaeal universal primers and sequences from each library constructed were obtained. Sequences of Bacteria from the phyla Bacteroidetes and Firmicutes were predominant. The overall dominant classes in the rumen were Clostridia and Bacteroidia, which are known to play a role in plant fiber degradation in other ruminants. Unclassified Bacteria accounted for 4.7% of the liquid fraction sequences and 16.4% of the solid fraction sequences. From the archaeal libraries only sequences from the phylum Euryarcheota were identified and were assigned to the class Methanobacteria of the genera Methanobrevibacter and Methanosphaera. A group of Archaea not previously known to be associated with the rumen was identified: uncultured methanogens belonging to the ?uncultured marine bacteria? groups II and III. The local water contained high salt concentrations and this may explain the presence of these groups in the Moxotó goat rumen. |
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Palavras-Chave: |
16S rRNA gene; Brasil; Diversidade genética; DNA sequence; Gene ribossomal 16S; Genetic diversity as resource; Northeastern; Raça Moxotó; Rumen microbiome. |
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Thesagro: |
Bactéria; Caatinga; Caprino; Rúmen. |
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Thesaurus Nal: |
Archaea; biodiversity; Brazil; Goats; Rumen bacteria; sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02552naa a2200433 a 4500
001 1938714
005 2015-05-26
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1016/j.anaerobe.2011.04.018$2DOI
100 1 $aCUNHA, I. S.
245 $aBacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2011
520 $aAbstract: Most studies present in the literature about the rumen microbiome have focused on cattle and sheep. This is the first report of the characterization of the bacterial and archaeal communities present in the liquid and solid-associated fractions of the rumen from free ranging Moxotó breed goats using 16S rRNA gene libraries. PCR was used to amplify the 16S rRNA gene with bacterial and archaeal universal primers and sequences from each library constructed were obtained. Sequences of Bacteria from the phyla Bacteroidetes and Firmicutes were predominant. The overall dominant classes in the rumen were Clostridia and Bacteroidia, which are known to play a role in plant fiber degradation in other ruminants. Unclassified Bacteria accounted for 4.7% of the liquid fraction sequences and 16.4% of the solid fraction sequences. From the archaeal libraries only sequences from the phylum Euryarcheota were identified and were assigned to the class Methanobacteria of the genera Methanobrevibacter and Methanosphaera. A group of Archaea not previously known to be associated with the rumen was identified: uncultured methanogens belonging to the ?uncultured marine bacteria? groups II and III. The local water contained high salt concentrations and this may explain the presence of these groups in the Moxotó goat rumen.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Registro |
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| Registros recuperados : 18 | |
| 4. |  | TUPINAMBÁ, D. D.; PALUAN, S. de F.; COSTA, O. Y. A.; BITENCOURT, A. C.; BERGMANN, J. C.; QUIRINO, B. F. Utilização da diversidade microbiana brasileira para a produção de etanol a partir de biomassa lignocelulósica. Microbiologia in Foco, São Paulo, ano 5, n. 21, p. 19-32, 2013.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 6. | | TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | CUNHA, I. S.; BARRETO, C. C.; COSTA, O. Y. A.; BOMFIM, M. A. D.; CASTRO, A. P. de; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Bacteria and Archaea community structure in the rumen microbiome of goats (Capra hircus) from the semiarid region of Brazil. Anaerobe, London, v. 17, n. 3, p. 118-124, Jul. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D. D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Avaliação da diversidade microbiana do processo de produção de etanol de cana-de-açúcar por meio de abordagem independente de cultivo. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 111 - 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 9. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; RAMOS, N. S. P. L.; FURTADO, R. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construction of metagenomic libraries with large inserts of DNA from the Amazonian soil microbiota and screening for enzymes with biotechnological potential. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programas e resumos... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 64-65.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 10. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BERGMANN, J. C.; KYAW, C. M.; KRUGGER, R. H.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Microbial diversity in sugarcane ethanol production in a Brazilian distillery using a culture-independent method. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, Epub ahead of print, 18 Nov. 2014. Não paginado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 11. | | QUIRINO, B. F.; BERGMAN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; PALUAN, S. G.; RAMOS, N. S. P. L.; SOUTO, B. de M.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Identification of glycosyl hydrolases in the microbial biodiversity of Brazil using a metagenomic approach. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 34., 2012, New Orleans. [Anais...]. Fairfax, VA: Society for Industrial Microbiology & Biotechnology, 2012. Não paginado. Poster Session 1: 7-44.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | QUIRINO, B. F.; CUNHA, I. S.; SOUTO, B. de M.; CARVALHO, L. S.; RAMOS, N. S. P. L.; COSTA, O. Y. A.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Characterization of the bacterial diversity in the goat rumen and identification of enzymes with potential use in the biofuels industry. In: ANNUAL MEETING AND EXHIBITION, 60., 2010, San Francisco, CA. Industrial microbiology and biotechnology. [S.l]: Society for Industrial Microbiology, 2010. p. 107 Poster abstract P9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; GLADDEN, J. M.; SINGER, S.; HEINS, R.; D'HAESELEER, P.; SIMMONS, B. A.; QUIRINO, B. F. Discovery of two novel b-glucosidases from an amazon soil metagenomic library. FEMS Microbiology Letters, 16 de dezembro, p. 1-9, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 14. | | RODRIGUES, G. R.; PINTO, O. H. B.; SCHROEDER, L. F.; FERNANDES, G. da R.; COSTA, O. Y. A.; QUIRINO, B. F.; KURAMAE, E. E.; BARRETO, C. C. Unraveling the xylanolytic potential of Acidobacteria bacterium AB60 from Cerrado soils. FEMS Microbiology Letters, v. 367, Issue 18, fnaa149, Sept. 2020. 367| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 15. | | BITENCOURT, A. C.; PORTELA, G. C.; SOUTO, B. de M.; COSTA, O. Y. A.; FAVARO, L. C. de L.; MENDES, T. D.; RODRIGUES, D. de S.; QUIRINO, B. F. Cellulolytic and accessory enzimes from brazilian microbiota for biomass deconstruction. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 106 - 108| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | KIELAK, A. M.; CASTELLANE, T. C. L.; CAMPANHARO, J. C.; COLNAGO, L. A.; COSTA, O. Y. A.; SILVA, M. L. C.; VAN VEEN, J. A.; LEMOS, E. G. M.; KURAMAE, E. E. Characterization of novel Acidobacteria exopolysaccharides with potential industrial and ecological applications. In: Scientific Reports, v. 7, 2017. Article 41193.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 17. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BERGMANN, J. C.; BITENCOURT, A. C. A.; MOURA, C.; SCHROEDER, L. F.; FRANCO, O. L.; QUIRINO, B. F. Microbial diversity in different stages of the ethanol production process using traditional techniques and molecular biology. In: REUNIÃO ANUAL DA SBBQ, 42., 2013, Foz do Iguaçu, PR. [Anais...] São Paulo: SBBq, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | RODRIGUES, L. P.; SCHROEDER, L. F.; RAMOS, N. S. P. L.; RAMOS, T. G.; MOURA, C. O.; SOUTO, B. de M.; BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; JUNIOR, D. A. J.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Prospecção de celulases e hemicelulases utilizando diferentes substratos por abordagem metagenômica. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos, SP. [Anais...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Asociación Latinoamericana de Microbiologia, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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